第21集 威震天抢走了一块极不稳定能量电池，汽车人飞过山发现霸天虎藏匿电池的地方就在幻影刚刚巡逻过的地方，他误会幻影是叛徒并对他横加指责。幻影为洗清飞过山 对自己的怀疑前往侦察，却恰巧被与霸天虎发生内讧的机器昆虫误伤。炸弹给其安装了脑控制弹控制了其的思想，使幻影听命于霸天虎的行动。这更让追踪幻影而来 的飞过山怀疑其是否已经变节，汽车人将信将疑，在夺回电池的激战中救护车发现了脑控制弹的秘密修好了幻影，幻影在电池爆炸前的危机时刻救了大家。飞过山和 幻影尽释前嫌。
第22集 汽车人的科学家千斤顶发明了静止器，这种仪器拥有将分子能量停止活动的威力。测试中铁皮因误会而将静止器的激化电池弄坏了大黄蜂和斯派克因此前往市区购买 新的电池，在电子游戏厅他们结识了对汽车人深感兴趣的美丽女孩卡瑞。卡瑞尾随他们前往汽车人司令部偷看静止器的实验，担任警戒任务的铁皮抓住了她也因此被 霸天虎偷袭得逞抢走了静止器。两次失误使得铁皮心灰意冷萌生退役的念头觉得愧疚的卡睿则只身潜入霸天虎的海底司令部希望弥补过失却不幸被抓获，铁皮终于重 新振作，最终救回了卡瑞并夺回了静止器。
第23集 挖地虎们制造了一个转换仪，它可以让变形金刚失去变形的能力。当探知汽车人正好在参加一个汽车锦标赛时，威震天派闹翻天将其使用在参加比赛的所有汽车人身 上。随后面对发动进攻的霸天虎，汽车人无力变形作战纷纷被俘虏。留守汽车人总部的千斤顶获悉这一情况后，发明了一个可以消除转换仪威力的射线炸弹。在威震 天毁掉汽车人之前、炸弹恢复了汽车人的变形能力，经过激战，霸天虎的诡计再一次失败了。
第24集 从大西洋底升起了古老的城市亚特兰第斯，神秘的海底人统治着那里。他们的首领龙王计划利用它们掌握的先进科技消灭全人类从而统治整个陆地世界，而霸天虎和 汽车人都发现了这一切。威震天妄图借助海底之国的力量消灭汽车人获得地球的全部能源，龙王则打算利用霸天虎来加速进攻的步伐。各怀鬼胎的双方联合向华盛顿 进军，而汽车人和人类则开始了这场保卫华盛顿的斗争。
第25集 深夜，威震天和声波混入了美国最大的研究设施：量子实验室。他们的目标是控制这里的超级智能计算机托克。威震天改造了托克并使他服从自己的命令，他利用托 克的强大力量去操纵世界上所有的油轮。以图得到所有的能源。得到消息的汽车人前往救援，在研究所却遭到了托克组织的机器人部队的阻击。直至机器恐龙赶到， 汽车人才控制住局势。历经艰险的汽车人凭着聪明才智，终于成功关闭了托克使油轮恢复了正常，赶走了霸天虎。
第27集 一场大地震过后，霸天虎在断层的山谷中发现了一种蕴含极大能量但却很不稳定的结晶状晶体。威震天心中又有了一个恶毒的计划他利用扫描仪队对擎天柱的身体构 造进行分析，制造了一个完全一样的假擎天柱打入汽车人司令部。妄图利用汽车人对领袖的信任把全体汽车人领入山谷被结晶毁灭。两个擎天柱在汽车人总部斗智斗 勇，真假难辨。在假擎天柱就要被汽车人认可的危险时刻，假擎天柱暴露出没有感情的本质而对面临危险的斯派克置之不理，据此汽车人辨出了真伪，消灭了假擎天 柱并救出了斯派克。
第28集 威震天在进行疯狂的地心钻探活动。如果成功，霸天虎将拥有无尽的能量，但失败的结果将是引发地球的爆炸。在外巡逻的幻影等汽车人发现了这件可怕的事情，赶 到阻止的擎天柱等人却打不过由机械部队组合而成的大力神。切普想出了一个好主意，他和千斤顶发明了一个控制器，当机械部队组合时汽车人就可以操纵大力神。 汽车人成功将控制器贴到了机器部队身上，但其实这是威震天看破了计划故意设下的圈套目的是借机消灭汽车人。双方的大战导致钻探失败，在爆炸即将发生的危急 时刻，最终是大力神阻止了钻探救了地球。
第29集 饥饿的机器昆虫们在疯狂的毁坏森林以获得能量，威震天借机邀请他们去袭击新星发电厂补充能源，其真实目的是借助他们的力量夺得铁岭的防卫计算机。补充了电 力的机器昆虫身体和力量都变得巨大无比，他们决定反叛。炸弹首先用脑控制弹控制了偷听到这一阴谋的声波，然后他们假借帮助威震天去进攻铁岭趁机夺取能源。 汽车人则发现新星发电厂的能源对机器昆虫而言极不稳定，机器昆虫随时可能爆炸，而他们前往攻击的铁岭基地也会毁灭。为保护铁岭，汽车人决定用解毒剂来阻止 机器昆虫的爆炸。
第30集 滑翔机和大黄蜂发现了一座恐龙岛，他们将这一消息报告给擎天柱。而此时的汽车人司令部，千斤顶正在向汽车人们演示机器恐龙的智慧。实验失败了，机器恐龙再 次将火山基地搞得乱七八糟。擎天柱于是命令钢锁将机器恐龙带到恐龙岛去进行训练，机器恐龙来到恐龙岛，在这里进行了战术练习。而得到消息的威震天也率领霸 天虎赶到了，他开始疯狂制造能量块，并驱动岛上的恐龙，将前来阻止的机器恐龙逼入了柏油坑之中……